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调试你的 Cython 程序

原文: http://docs.cython.org/en/latest/src/userguide/debugging.html

Cython 附带了 GNU Debugger 的扩展,可以帮助用户调试 Cython 代码。要使用此功能,您需要安装 7.2 或更高版本、带 Python 支持(链接到 Python 2.6 或更高版本)进行构建的版本。调试器支持 2.6 及更高版本的调试对象。对于 Python 3,代码应该使用 Python 3 构建,调试器应该使用 Python 2 运行(或者至少它应该能够找到 Python 2 Cython 安装的位置)。请注意,在最新版本的 Ubuntu 中,安装 apt-getgdb 配置了 Python 3。在这样的系统上,可以通过下载 gdb 源然后运行来获得 gdb 的正确配置。 :

./configure --with-python=python2
make
sudo make install

安装Cython调试器可能会比较困难。可以看一下安装脚本和样例代码

调试器将需要 Cython 编译器可以导出的调试信息。这可以通过将 gdb_debug=True 传递给 cythonize() 在设置脚本中实现:

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension

extensions = [Extension('source', ['source.pyx'])]

setup(..., ext_modules=cythonize(extensions, gdb_debug=True))

对于开发场景,将 --inplace 标志传递给 setup.py 脚本通常很有帮助,这使得 setuptools "原位"地构建项目,即不在单独的 build 目录中。

直接从命令行调用 Cython 时,可以使用 --gdb 标志写入调试信息:

cython --gdb myfile.pyx

运行调试器

要运行 Cython 调试器并让它导入 Cython 导出的调试信息,请在构建目录中运行 cygdb

$ python setup.py build_ext --inplace
$ cygdb
GNU gdb (GDB) 7.2
...
(gdb)

使用 Cython 调试器时,最好使用使用带调试标识符编译的解释器构建并运行代码(即使用 --with-pydebug 配置项目或使用 -g CFLAG 编译)。如果您的包由管理器管理器安装和管理,则可能需要单独安装调试支持。如果使用 NumPy,那么你还需要安装 numpy 调试,否则你会看到multiarray导入错误。例如。对于 ubuntu:

$ sudo apt-get install python-dbg python-numpy-dbg
$ python-dbg setup.py build_ext --inplace

然后你还需要用 python-dbg 运行你的脚本。确保在使用调试符号构建包时,如果先前已编译了 cython 扩展,会重新编译。如果您的软件包受版本控制,您可能需要在构建之前执行 git clean -fxdhg purge --all

您还可以将其他参数传递给 gdb:

$ cygdb /path/to/build/directory/ GDBARGS

例如

$ cygdb . -- --args python-dbg mainscript.py

要告诉 cygdb 不要导入任何调试信息,请提供 -- 作为第一个参数:

$ cygdb --

使用调试器

Cython 调试器附带了一组支持断点,堆栈检查,源代码列表,步进,单步执行等命令。大多数这些命令与它们各自的 gdb 命令类似。

cy break breakpoints...

在 Python,Cython 或 C 函数中设置断点。首先,它将查找具有该名称的 Cython 函数,如果 cygdb 不知道具有该名称的函数(或方法),它将设置一个(待定的)C 断点。 -p 选项可用于指定 Python 断点。

可以为函数或方法名设置断点,也可以使用完整名称来设置断点,这意味着需要给出函数的完整“路径”:

(gdb) cy break cython_function_or_method
(gdb) cy break packagename.cython_module.cython_function
(gdb) cy break packagename.cython_module.ClassName.cython_method
(gdb) cy break c_function

您还可以对 Cython 代码行号设置断点:

(gdb) cy break :14
(gdb) cy break cython_module:14
(gdb) cy break packagename.cython_module:14

Python 断点当前支持模块的名称(不是整个包路径)和函数或方法:

(gdb) cy break -p python_module.python_function_or_method
(gdb) cy break -p python_function_or_method

注意:Python 断点仅适用于 Python 构建,其中可以从调试器中读取 Python 帧信息。要确保这一点,请使用 Python 调试版本或没有剥离调试支持编译版本。 译者注: step into, step over, breakpoint这些概念不熟悉的话可以先熟悉一下IDE的debug功能

cy step

逐步完成 Python,Cython 或 C 代码。直接从被认为是相关的 Cython 代码调用的 Python,Cython 和 C 函数中调用,并且会步入(step into)。

cy next

Step over Python,Cython 或 C 代码。

cy run

运行程序。默认解释器是用于构建扩展的解释器、或者是在“不导入调试信息”选项生效的情况下运行cygdb的解释器。可以使用 gdb 的 file 命令覆盖解释器。

cy cont

继续运行程序

cy up

cy down

在堆栈中上下移动到被认为是相关的帧。

cy finish

执行直到满足向上相关的帧或停止执行。

cy bt

cy backtrace

打印所有相关的帧数的回溯信息。 -a 选项使其打印完整的回溯(所有 C 帧)。

cy select

cy backtrace 列出的编号选择堆栈帧。引入此命令是因为 cy backtrace 打印反向堆栈跟踪,因此帧编号与 gdb 的 bt 不同。

cy print varname

打印本地或全局 Cython,Python 或 C 变量(取决于上下文)。变量也可能被解除引用:

(gdb) cy print x
x = 1
(gdb) cy print *x
*x = (PyObject) {
    _ob_next = 0x93efd8,
    _ob_prev = 0x93ef88,
    ob_refcnt = 65,
    ob_type = 0x83a3e0
}

cy set cython_variable = value

将 Cython 堆栈上的 Cython 变量设置为 value。

cy list

列出当前行周围的源代码。

cy locals

cy globals

打印所有本地和全局变量及其值。

cy import FILE...

从作为参数提供的文件中导入调试信息。导入调试信息的最简单方法是使用 cygdb 命令行工具。

cy exec code

在当前的 Python 或 Cython 框架中执行代码。这就像 Python 的交互式解释器一样。

对于 Python 帧,它使用 Python 框架中的全局变量和局部变量;对于 Cython 帧,它使用 Cython 模块上使用的全局变量的字典 和创建一个填充了本地 Cython 变量的字典。

注意: cy exec 修改状态并在调试对象中执行代码,因此可能存在危险。

例:

(gdb) cy exec x + 1
2
(gdb) cy exec import sys; print sys.version_info
(2, 6, 5, 'final', 0)
(gdb) cy exec
>global foo
>
>foo = 'something'
>end

便利函数

以下函数是 gdb 函数,这意味着它们可以在 gdb 表达式中使用。

cy_cname(varname)

返回 Cython 变量的 C 变量名。对于全局变量,这可能实际上不是有效的。

cy_cvalue(varname)

返回 Cython 变量的值。

cy_eval(expression)

在最近的 Python 或 Cython 框架中求值 Python 代码,并将表达式的结果作为 gdb 值返回。如果成功则提供新引用,出错时为 NULL。

cy_lineno()

返回所选 Cython 帧中的当前行号。

Example:

(gdb) print $cy_cname("x")
$1 = "__pyx_v_x"
(gdb) watch $cy_cvalue("x")
Hardware watchpoint 13: $cy_cvalue("x")
(gdb) cy set my_cython_variable = $cy_eval("{'spam': 'ham'}")
(gdb) print $cy_lineno()
$2 = 12

配置调试器

调试器的一些方面可以使用 gdb 参数进行配置。例如,可以禁用颜色,可以配置终端背景颜色和断点自动完成。

cy_complete_unqualified

告诉 Cython 调试器cy break是否还应该完成普通函数名称,即不以其模块名称为前缀。例如。如果你有一个名为spam的函数,在模块M中,它会告诉你是仅完成M.spam还是只完成spam

默认值为 true。

cy_colorize_code

告诉调试器是否着色源代码。默认值为 true。

cy_terminal_background_color

告诉调试器有关终端背景颜色的信息,这会影响源代码着色。默认值为“dark”,另一个有效选项为“light”。

这是这些参数的使用方式:

(gdb) set cy_complete_unqualified off
(gdb) set cy_terminal_background_color light
(gdb) show cy_colorize_code



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